Unia Miasteczek ma swoich przedstawiciel w wielu gremiach systemu państwowego. Jednym z nich jest Komisja Wspólna Rządu i Samorządu Terytorialnego (KWRiST) stanowiąca forum współpracy przy tworzeniu wspólnych stanowisk rządu i samorządu terytorialnego w sprawach ważnych z punktu widzenia polityki państwa oraz zadań samorządu terytorialnego, w szczególności przez:
- określanie priorytetów gospodarczych i społecznych w sprawach dotyczących funkcjonowania samorządu terytorialnego,
- ocenę funkcjonowania i warunków rozwoju systemu samorządu terytorialnego,
- inicjowanie prac związanych z przygotowaniem aktów prawnych dotyczących samorządu terytorialnego,
- analizowanie informacji o przygotowywanych aktach prawnych, programach rządowych i innych dokumentach dotyczących problematyki samorządu terytorialnego oraz prognozach ich skutków finansowych,
- opracowywanie założeń i opiniowanie projektów aktów prawnych, programów rządowych i innych dokumentów dotyczących problematyki samorządu terytorialnego,
- określenie zadań administracji publicznej związanych z przygotowaniem struktur samorządu terytorialnego do procesu integracji z Unią Europejską i zagwarantowania polskich interesów narodowych w ramach tego procesu.
Obecnie zasady funkcjonowania Komisji Wspólnej regulują przepisy Ustawy z dnia 6 maja 2005 r. o Komisji Wspólnej Rządu i Samorządu Terytorialnego oraz o przedstawicielach Rzeczypospolitej Polskiej w Komitecie Regionów Unii Europejskiej (Dz. U. nr 90, poz. 759).
W skład Komisji Wspólnej wchodzi 12 przedstawicieli strony rządowej i 12 - strony samorządowej. Rząd reprezentują:
1. Grzegorz Schetyna - minister spraw wewnętrznych i administracji, współprzewodniczący KWRiST
2. Michał Boni – minister, członek Rady Ministrów
3. Stanisław Gawłowski- sekretarz stanu w Ministerstwie Środowiska
4. Marek Chaber - podsekretarz stanu w Ministerstwie Zdrowia
5. Tomasz Siemoniak - sekretarz stanu w Ministerstwie Spraw Wewnętrznych i Administracji
6. Elżbieta Suchocka-Roguska - sekretarz stanu w Ministerstwie Finansów
7. Krystyna Szumilas - sekretarz stanu w Ministerstwie Edukacji Narodowej
8. Rafał Baniak - podsekretarz stanu w Ministerstwie Gospodarki
9. Olgierd Dziekoński - podsekretarz stanu w Ministerstwie Infrastruktury
10. Krzysztof Hetman - podsekretarz stanu w Ministerstwie Rozwoju Regionalnego
11. Artur Ławniczak - podsekretarz stanu w Ministerstwie Rolnictwa i Rozwoju Wsi
12. Czesława Ostrowska - podsekretarz stanu w Ministerstwie Pracy i Polityki Społecznej.
Stronę samorządową stanowią wyznaczeni przedstawiciele ogólnopolskich organizacji jednostek samorządu terytorialnego. Są to reprezentanci: Unii Metropolii Polskich, Unii Miasteczek Polskich, Związku Województw RP, Związku Miast Polskich, Związku Powiatów Polskich oraz Związku Gmin Wiejskich RP. W pracach Komisji biorą udział:
1. Piotr Uszok - prezydent Miasta Katowice, współprzewodniczący KWRiST, sekretarz Zarządu Unii Metropolii Polskich
2. Jan Kozłowski - marszałek Województwa Pomorskiego, prezes Zarządu Związku Województw RP
3. Marek Nawara - marszałek Województwa Małopolskiego, Związek Województw RP
4. Paweł Adamowicz - prezydent Miasta Gdańska, prezes Unii Metropolii Polskich
5. Ryszard Grobelny - prezydent Miasta Poznania, prezes Związku Miast Polskich
6. Witold Krochmal - burmistrz Wołowa, prezes Unii Miasteczek Polskich
7. Jerzy Kropiwnicki - prezydent Miasta Łodzi, Związek Miast Polskich
8. Andrzej Jęcz - starosta Kościański, Związek Powiatów Polskich
9. Andrzej Wąsik - starosta Wrocławski, Związek Powiatów Polskich
10. Stanisław Bodys - burmistrz Rejowca Fabrycznego, Unia Miasteczek Polskich
11. Mariusz Poznański - wójt Gminy Czerwonak, Związek Gmin Wiejskich RP
12. Krzysztof Iwaniuk - wójt Terespola, Związek Gmin Wiejskich RP
W ramach KWRiST działa siedem stałych zespołów problemowych. Komisja Wspólna może także powoływać doraźne zespoły problemowe.